Oublier tout ce que vous savez sur le Monde Shinobi, plus rien n'existe de cela, à force de vouloir puissance et gloire les Shinobi on détruit leur terre. Pein, ayant réussi à réunir tous les Bijuu (Sauf Kyuubi), décida de tuer Tobi le seul rempart dresser contre sa conquête du monde. Le Combat fut terrible et il se conclua par la mort de ses deux puissants hommes. C'est doucement que les maitres des arts Ninja refont surface, toujours aussi fort qu'auparavant ils demeurent cependant moins nombreux. Un groupe de vaillant homme on construit un nouveau village cachée, réunissant un bon nombre de ninja. A sa tête, aucun homme, non ! Mais un dieu, une divité inconnue qui se terre dans son temple à l'abri des regards indiscret, menant le village à la baguette. Mais autour de cela, les shinobis n'appartenant pas au village jalouses, certain vagabond, d'autre Nukenin. D'autres villages sont amenés à émerger, la guerre frappe à la porte ...
Les Shinobi de la grande époque sont en vie, la plupart déchu. Sasuke n'as pas réussi à battre Itachi qui reste proche de la mort, il s'est donc allié à la cause de cette divinité en rejoignant Gama espérant obtenir une puissance suffisante. L'Akatsuki se reforme.